研究人员对黎凡特棉花基因组进行测序

科学家团队对草棉品种 Wagad 的基因组进行了测序和组装，这是该物种的第一个驯化品种。

棉属棉是全世界天然纤维的主要来源。

虽然该属本身由 50 多个已知物种组成，但只有四个物种的纤维适合纺织品生产。

值得注意的是，这四个物种都是独立驯化的，提供了一个自然复制的实验，研究人员可以通过该实验了解导致表型趋同的潜在遗传变化。

虽然许多研究都集中在了解陆地棉和海岛棉这两种主要栽培物种的驯化方面，但对“短绒棉”、草棉(俗称黎凡特棉)和树棉的驯化知之甚少。

草棉品种 Wagad的染色体水平基因组是通过结合 PacBio 长读长技术、HiC 和 Bionano 光学图谱生成的。

“我们技术的力量在于，它使我们能够创建高质量的基因组，提供以前不可能实现的详细程度，”德保罗大学研究员 Thiru Ramaraj 博士说。

“这为更多研究人员对许多对全球经济和养活人口很重要的作物进行测序提供了可能性。”

该团队注释了 Wagad 品种基因组的 39,100 个独特基因并记录了它们的功能。

“当我们研究基因组区域时，我们发现了许多与纤维含量相关的基因，”德保罗大学研究生 Azalea Mendoza 说。

“看到这项工作在现实生活中的应用真是令人难以置信。”

作者还将 Wagad 品种的基因组与野生草棉亚种非洲的现有基因组进行了比较。

他们说：“我们的结果证明了草棉品种 Wagad 基因组在了解二倍体物种驯化方面的实用性，这可以为现代育种计划提供信息。”

研究结果发表在《G3：基因、基因组、遗传学》杂志上。