基因组学和图像引导的亚型分型完善了阿尔茨海默病的特征
一种结合基因组和 tau PET 成像数据的新计算技术有望为阿尔茨海默病亚型分型提供更加个性化的方法。基于使用稀疏典型相关分析 (SCCA) 的新型聚类框架,该集成方法成功识别了阿尔茨海默病的四种亚型以及与每种亚型相关的顶级基因。这项研究已在 2023 年核医学和分子影像学会年会上发表。
阿尔茨海默病是一种复杂的遗传性疾病。根据淀粉样斑块和 tau 神经原纤维缠结(该疾病的病理标志)的 PET 成像,已鉴定出该疾病的几种亚型。此外,最近的全基因组关联研究已经确定了许多在阿尔茨海默病的发展中发挥作用的基因。
该大学生物医学工程系副教授 Joyita Dutta 博士表示:“通过使用成像和基因组信息识别阿尔茨海默病的不同亚型,研究人员可以获得对该疾病的潜在生物学及其进展的潜在新见解。”马萨诸塞州阿默斯特,马萨诸塞州。“了解每种亚型的特定遗传关联也可能导致未来个性化治疗方法的发展。”
研究中利用了阿尔茨海默病神经影像计划 (ADNI) 的影像和基因组数据。所有接受过18 次治疗的 ADNI 参与者包括 F-flortaucipir PET 和 Illumina SNP 基因分型(总共 541 名参与者;334 名认知正常,207 名认知受损)。根据 tau PET 成像计算出 10 个广泛区域的 Tau PET 标准化摄取值比率,并从 SNP 基因分型中鉴定并提取了与阿尔茨海默病相关的 145 个基因组变异。然后将 SCCA 聚类框架联合应用于 tau PET 和基因组数据集。
分析中确定了阿尔茨海默病的四种亚型:内侧颞叶 (MTL) 主导型、后侧型、MTL 保留型和外侧颞叶型。除了 APOE 基因之外,还鉴定了与每个亚型相关的顶级基因。
“基因组学和成像引导的个体化亚型对于阿尔茨海默病至关重要,因为不同的亚型也可能具有不同的认知能力下降速度和特征,可能会影响临床试验结果和治疗反应,”杜塔说。“通过将分子成像信息与基因组学相结合,我们创建了一种可以真正针对每位患者进行个性化的诊断技术。这对于许多疾病类型(而不仅仅是阿尔茨海默病)具有广泛的诊断用途。”
摘要 1377。“使用 tau PET 和基因组学进行阿尔茨海默病亚型分型的 SCCA 聚类框架”,Fan Yang 和 Joyita Dutta,马萨诸塞州阿默斯特市马萨诸塞大学;马修·马赫 (Matthew Maher) 和里查·萨克塞纳 (Richa Saxena),马萨诸塞州总医院,马萨诸塞州波士顿。
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