链的英文 chain
网上有很多关于链的英文的问题,也有很多人解答有关chain的知识,今天艾巴小编为大家整理了关于这方面的知识,让我们一起来看下吧!
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一、使用liftover创建注释Chain文件(基因组坐标转换)
二、链的英文

一、使用liftover创建注释Chain文件(基因组坐标转换)
组装一组基本的起作用的因子后,您将希望看到自己序列的组装情况和染色体方向,或者您将希望基于现有的基因组注释文件创建自己的基因组注释文件。这时候需要的是一个链文件来转换坐标。
一般在ucsc的官网下,会有一些不同版本的基因组链文件,有时候我们需要用自己的序列来生成自己的链文件。在这里,我们记录liftover的360的问答。这里我们用自己的自组装序列asm.fa和hg19来创建。为了避免不必要的bug,我们根据文档建立文件夹和操作。在~/.bashrc后添加程序路径,另外还需要搭建一个parasol集群环境:
参考:http://基因组维基。* * *.edu/index.php/par原手春城超刑银行asol_job_cont货物存储rol_system需要注意的是,文档中并没有提到需要免密ssh localhost,所以需要手动配置免密ssh local,剩下的可以按照文档的要求来做。把自己的序列分别压缩成asm.fa.gz和hg19.fa.gz/home/jfh/projects/hic _ ana亲汽车委员会似的工钟观察lysis/data/lift over/data/g Tell enomes/ASM/a不要试错,sm.fa.gz创建ooc文件。
bla tasm . 2 bit/dev/null/dev/null-tile size=强冷平台核环境激发室-增矛11 -makeO粮周应在严格oc=asm.ooc -repMatch=1024结束时lifting over正在运行,parasol可能会停止运行。机器颜色微型取景器提示生病的机器。这时候只要进入batch所在的目录,运行下面的命令:最后在你改的目标文件夹下就可以看到asmToHg19.over.chain.gz了,就可以使用了。
二、链的英文
链的英文如下:
Chain是英制长度单位,定义为66英尺(20.1168米),也称为“冈特链”。知识拓展:金属链环做成的绳子:~儿子。~轨道(履带)。物品~。锁定~ ~型反应。海洋上测量距离的长度单位,十分之一海里为一链,为185.2米。(1)(声音和声音。从金,麻烦。(lin)本义:铅矿)(2)链条【链条】现在的人,都把彼此联系在一起的人当做链条。—— 《六书故》 (3)再比如铁链;链子
以上就是关于链的英文的知识,后面我们会继续为大家整理关于chain的知识,希望能够帮助到大家!
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