FindVariableFeatures features
网上有很多关于FindVariableFeatures的问题,也有很多人解答有关features的知识,今天艾巴小编为大家整理了关于这方面的知识,让我们一起来看下吧!
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一、FindVariableFeatures
单细胞文章很少。在重现文章数据时,发现有些文章提供的是经过处理的单细胞矩阵,而不是原来的计数。有些数据甚至来自于缩放数据,所以我有一个疑问:直接使用缩放数据可以进行单细胞分析吗?
分析单个像元数据有几个主要步骤:lognormalized、FindVariableFeatures、scaledata、PCA和FindClusters。其中,lognormalized和scaledata的步骤可以跳过,但FindViable特征用于发现高度可变的基因。关于高变异基因的发现,似乎只有规模化的数据做不到360问答,这一步的高变异基因对于后续的PCA分析也是不能省略的。所以,我只想看FindViable Features(修拉V3版)的源代码:
可以看出,高变基因的获取是利用原始计数搜索空间的简化矩阵或对数归一化数据的J来计算的,也就是说,seurat的作者认为标度数据计算高变基因的弱洞可能不准确,所以本文只提供了一个裂纹描述来事先得到信息,标度数据不能用来计算高变基因。
当然也会有人好奇(太)和(刚)问,我就是想用规模化的数据让迅宗科代表Namara孤军奋战,活在FindV里的ariableFeatures里。等待正确的连锁后,我会得到更可靠的高变异基因吗?因此,我测试了使用计数、对数归一化数据、sc预指导和aled数据来获得高度可变的基因:可以看出,通过缩放数据计算的高度可变的基因与通过计数、数据数据计算的高度可变的基因有很大的不同。
那么如果没有高度可变的基因,PCA等降维分析就不能进行了吗?理论上当然不是。RunPCA可以指定自己的基因运行。
二、features中文翻译
功能:美颜[' fitr];英语特征;特点;特色;故事片.具有.的特征;发挥重要作用;重要复数:特征过去分词:特征现在分词:feat双语例句:
Perhaps the only surprise is that it took so long to gain a foothold on the British side of the Atlantic Ocean. The only unusual thing is that it took so long to take root on the British side of the Atlantic. The distinctive feature of this cult is a spirit of luxury and an attempt to do something unusual. The remarkable characteristics of this fanatical pursuit are indulgence attitude and desire to make an extraordinary career.
Masks have always been the main feature of Venice Carnival. Masks are the brightest feature of Venice Carnival. 4. Because of this characteristic, the copolymer can be used in optical products. Due to such a characteristic, the copolymer can be used in optical products.
以上就是关于FindVariableFeatures的知识,后面我们会继续为大家整理关于features的知识,希望能够帮助到大家!
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